הירידה ברמת האסטרוגן גורמת לשינויים בדופן הנרתיק ובמערכת השתן. הרקמה המצפה את דופן הנרתיק נעשית דקה יותר, נעלמת אוכלוסיית החיידקים הטבעית הנמצאת שם, וחומציות הנרתיק יורדת. שינויים אלה מקטינים את עמידות הנרתיק ומערכת השתן בפני זיהומים. לכן תיתכן בגיל המעבר, עליה בשכיחות הזיהומים בנרתיק ובמערכת השתן. טיפול הורמונאלי חליפי עשוי למנוע זיהומים כאלה. ניתן לטפל באופן מקומי על-ידי קרם הורמונאלי פתילות נרתיקיות או על- ידי טיפול דרך הפה. (ראה ערך "יובש בנרתיק").